【笔记】医疗影像图像格式
1.Dicom
扩展名:.dcm
来源:ACR/NEMA协会
Dicom属于最常见的格式之一,一个Dicom文件包含了基本的病人信息以及图像信息
病人信息
- 病人ID
- 姓名
- 检查日期
- ......
图像数据
- 数据位数
- 符号位
- 宽高
- 最大最小值
2.NIfTI
扩展名:.nii 或 img/.hdr
来源:NIH影像学信息工具倡议
NIfTI格式主要是为了克服以前数据格式问题而引入的,先前格式的主要问题可能是缺乏有关空间方向的足够信息,以致于不能明确解释存储的数据。尽管该文件被许多不同的成像软件所使用,但是缺少足够的方向信息,某些(尤其是spm)必须为每个分析文件包括一个描述方向的随附文件,例如带有扩展名的文件.mat。
为了保持与先前格式的兼容性,以nifti格式存储的数据还使用了一对文件.hdr/.img。注意,nifti格式的内部结构将与分析格式的结构基本兼容。但是,新格式增加了一些巧妙的改进。与每个图像一样,使用一对文件.hdr/.img而不是仅一个,不仅带来不便,而且还容易出错,因为您可能会轻易忘记(或不知道)所关注的数据实际上被拆分为多个文件。为了解决这个问题,nifti格式还允许将其扩展名为,作为单个文件存储.nii。
3.ANALYZE(梅奥医学影像)
扩展名:img/.hdr
来源:Analyze软件,梅奥临床医学中心
4.NRRD
扩展名:.nrrd
来源:
灵活的NRRD格式包含了一个单独的头文件和若干个可以被结合在一起或者分开的图像文件。NRRD头文件为科学可视化和图像处理准确地表征了N维光栅信息。
NRRD格式表征扩散加权图像(DWI)体积和扩散张量图像(DTI)。
为了目视确认张量的方向和期望的神经解剖学的结构一致,NRRD DWI 和 NRRD DTI 数据能够被读取为 3D 切片。
5.MINC
扩展名:.mnc
来源:蒙特利尔神经学研究所
MINC 代表的是医疗图像 NetCDF 工具包
MINC2 从 NetCDF变换成了HDF5,HDF5支持无限制多的数据类型,并且是为灵活高效的I/O和大容量的复杂数据而设计的,有助于MINC2处理大量的复杂数据集。